海洋生態與保育研究所自109學年度第一屆招生起，每年均有學生透過學術研究，以保持良好水產養殖管理的目標，執行研究並發表成學術論文。

符合14.5.3 保持良好水產養殖管理的計畫

1.七股潟湖養殖牡蠣寄生性鑽孔生物的物種多樣性及其對宿主之影響研究(林芷晴，112學年度畢)
2.海水酸化對線紋海馬子代孵化之影響(余奕穎，112學年度畢)
3.魚苗密度對存活率及多樣性之影響一以無機營養鹽養殖法為例(詹姿祐，112學年度畢)